MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 5713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	TTTTTA	2	12	78	89	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007576	TTG	2	6	107	112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007576	T	8	8	121	128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007576	TCTT	2	8	150	157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007576	GTG	2	6	179	184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007576	GAG	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007576	CTA	3	9	1671	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007576	AT	5	10	1698	1707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007576	AAC	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007576	T	7	7	2912	2918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007576	AAAT	2	8	2933	2940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007576	TAG	2	6	2967	2972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007576	A	6	6	3039	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007576	TAAT	2	8	3085	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007576	TGG	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007576	ATA	2	6	4483	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007576	GACT	2	8	6510	6517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007576	A	7	7	9115	9121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007576	T	8	8	9182	9189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007576	AGG	2	6	9333	9338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007576	AGG	2	6	10212	10217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007576	AATT	2	8	10467	10474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007576	TCA	2	6	10481	10486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007576	TTGG	2	8	10498	10505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007576	T	6	6	10510	10515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007576	GTT	2	6	10623	10628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007576	TGC	2	6	10641	10646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007576	GGT	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007576	T	6	6	13191	13196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007576	TAT	2	6	13240	13245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007576	GA	3	6	13264	13269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007576	ACT	2	6	14771	14776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007576	GTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007576	TAAA	2	8	14835	14842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007576	CAA	2	6	14933	14938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007576	CGT	2	6	14972	14977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007576	A	6	6	15021	15026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007576	AATT	2	8	15039	15046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007576	ATTT	2	8	16437	16444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007576	A	6	6	16494	16499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007576	ATA	2	6	16505	16510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007576	CTTA	2	8	16576	16583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007576	A	6	6	16630	16635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007576	GTT	2	6	16636	16641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007576	T	6	6	16678	16683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007576	ACTT	2	8	16686	16693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007576	TAA	2	6	16760	16765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007576	GAG	2	6	16766	16771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007576	A	6	6	20343	20348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007576	GAG	3	9	21455	21463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007576	TAGC	2	8	22950	22957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007576	GCTA	2	8	22981	22988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007576	CAAA	2	8	22997	23004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007576	G	6	6	23016	23021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007576	ATT	2	6	23072	23077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007576	G	6	6	23080	23085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007576	GGA	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007576	AGT	2	6	23152	23157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007576	A	7	7	23245	23251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007576	CCT	2	6	24465	24470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007576	TA	3	6	24482	24487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007576	TAA	2	6	24502	24507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007576	GAC	2	6	24600	24605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007576	T	6	6	24639	24644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007576	T	6	6	24647	24652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007576	CTT	2	6	24660	24665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007576	GGC	2	6	24673	24678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007576	AAC	2	6	24722	24727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007576	TTA	2	6	24778	24783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007576	GCG	2	6	24787	24792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007576	A	7	7	24794	24800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007576	GCG	2	6	24949	24954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007576	CGG	2	6	24992	24997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007576	GGC	2	6	24999	25004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007576	ACC	2	6	25011	25016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007576	CAT	2	6	25083	25088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007576	TTA	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007576	CAGT	2	8	25160	25167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007576	GCA	2	6	25201	25206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007576	CTTG	2	8	25207	25214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007576	TCC	2	6	25226	25231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007576	GAA	2	6	25270	25275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007576	ATT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007576	GTT	2	6	25378	25383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007576	A	7	7	25425	25431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007576	T	7	7	25467	25473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007576	CCT	2	6	26566	26571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007576	GATA	2	8	26573	26580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007576	CACT	2	8	26602	26609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007576	TGG	2	6	26639	26644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007576	GAT	2	6	26665	26670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007576	TGCT	2	8	27083	27090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007576	T	6	6	28047	28052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007576	AT	3	6	29493	29498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007576	TAAT	2	8	29515	29522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007576	T	6	6	29554	29559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007576	ACG	2	6	29590	29595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007576	GCT	2	6	29610	29615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007576	AG	4	8	29620	29627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007576	CTT	2	6	30498	30503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007576	CTT	2	6	31809	31814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007576	AAC	2	6	31819	31824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007576	TAG	2	6	31865	31870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007576	CCTT	2	8	32248	32255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007576	TAA	2	6	32265	32270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007576	TTA	2	6	32292	32297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007576	TTG	2	6	33506	33511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007576	AAG	2	6	35602	35607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007576	GTA	2	6	36639	36644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007576	A	6	6	37173	37178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007576	ATG	2	6	37815	37820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007576	CA	3	6	37862	37867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007576	T	6	6	38407	38412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007576	T	8	8	38436	38443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007576	A	8	8	38473	38480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007576	A	6	6	38482	38487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007576	GAG	2	6	38518	38523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007576	TTTTG	2	10	39983	39992	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007576	AGG	2	6	40022	40027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007576	GTA	2	6	40819	40824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007576	AGG	2	6	40835	40840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007576	A	6	6	41073	41078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007576	GT	3	6	41127	41132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007576	CA	3	6	41138	41143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007576	A	6	6	42359	42364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007576	ATT	2	6	42441	42446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007576	ATG	2	6	42470	42475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007576	GGA	2	6	42492	42497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007576	CTT	2	6	43829	43834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007576	AAT	2	6	44199	44204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007576	TAA	3	9	44239	44247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007576	A	7	7	44246	44252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007576	T	9	9	44275	44283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007576	GAC	2	6	45483	45488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007576	TAGAA	2	10	45497	45506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007576	AAAG	2	8	45520	45527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007576	T	7	7	46018	46024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007576	AAT	4	12	46030	46041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007576	AGT	2	6	46072	46077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007576	TAA	2	6	46078	46083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007576	GAG	2	6	46089	46094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007576	CAT	2	6	48249	48254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007576	AGA	2	6	48261	48266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007576	AAT	2	6	48297	48302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007576	GAATT	2	10	48343	48352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007576	GAG	2	6	48364	48369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007576	A	6	6	50276	50281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007576	CTG	2	6	50332	50337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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